Niedawno poproszono nas o opinie podatkową, czy z faktury dokumentującej zakup nieruchomości będzie można odliczyć podatek naliczony przy tej transakcji. Firma, która kupiła nieruchomość była czynnym podatnikiem VAT i chciała wykorzystywać zakupiony budynek do celów związanych z jej działalnością gospodarczą opodatkowaną podatkiem VAT. Faktura wyglądała na wystawioną prawidłowo, dane były zgodne z aktem notarialnym, w którym stwierdzono, że transakcja podlegała podatkowi VAT. Przy dokładnym sprawdzaniu stanu faktycznego dotyczącego zakupionej nieruchomości, okazało się jednak, że zarówno sprzedawca jak i notariusz mylnie stwierdzili, że sprzedaż tej nieruchomości powinna polegać temu podatkowi. Niestety nie został odpowiednio wnikliwie sprawdzony warunek tak zwanego pierwszego zasiedlenia, mający wpływ na opodatkowanie lub zwolnienie. Ze stanu faktycznego wynikało, że transakcja ta była zwolniona z podatku VAT. Nasz klient miał fakturę z naliczonym podatkiem VAT (sprzedawca przelał podatek VAT do urzędu skarbowego)  i chciał wykorzystywać nieruchomość do celów związanych z działalnością opodatkowaną tym podatkiem ale nie mógł odliczyć tego podatku z faktury zakupu. Z jakiego powodu? Zgodnie z art. 88 ustawy o VAT nie można odliczać podatku naliczonego w przypadku gdy transakcja nie podlega opodatkowaniu albo jest z niego zwolniona. Tak było właśnie w tym przypadku. Transakcja była zwolniona z VAT i mimo tego, że wystawiono fakturę (i sprzedawca przelał podatek na konto w urzędzie skarbowym) to nabywca nieruchomości nie mógł tego podatku odliczyć.