Po sześciu latach polskie organy skarbowe zmieniły zdanie w sprawie podatku VAT zapłaconego za granicą. Bardzo często w praktyce do księgowości trafiają faktury (choćby za zakupione paliwo) zawierające podatek VAT zapłacony za granicą. Polskie organy podatkowe twierdziły od 2005 roku, że zagraniczny podatek VAT nie może być kosztem, ponieważ należy go traktować tak samo jak polski podatek od towarów i usług. Było to zupełnie pozbawione podstaw prawnych, ustawa o VAT wyraźnie odróżniała podatek od wartości dodanej (zagraniczny) od podatku od towarów i usług (obowiązujący w Polsce). W konsekwencji takiej interpretacji, zaliczenie faktury zawierającej zagraniczny podatek VAT skutkowało zdaniem fiskusa zawyżeniem kosztów podatkowych.
Dopiero w Biuletynie Skarbowym Ministerstwa Finansów nr 2 z 2012 r. Departament Podatków uznał, że podatek od wartości dodanej zapłacony za granicą jest kosztem podatnika. W ślad za tym zmienionym stanowiskiem pojawiły się interpretacje podatkowe stwierdzające, że omawiane wydatki stanowią koszt uzyskania przychodu w kwocie brutto.